Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN16Q9UKR8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN16Q9UKR8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms