Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNL1Q9UK58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCNL1Q9UK58 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNL1Q9UK58 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms