Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSKSQ9UJT2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSKSQ9UJT2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms