Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATPIF1Q9UII2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATPIF1Q9UII2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms