Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMPXQ9UHP9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms