Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX25Q9UHL0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms