Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBGCP4Q9UGJ1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBGCP4Q9UGJ1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms