Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NLKQ9UBE8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NLKQ9UBE8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms