Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GALPQ9UBC7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GALPQ9UBC7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms