Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMCD1Q9NZU5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LMCD1Q9NZU5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms