Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD4Q9NZQ9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD4Q9NZQ9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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