Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NKIRAS2Q9NYR9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKIRAS2Q9NYR9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms