Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC5A4Q9NY91 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A4Q9NY91 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms