Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TUBA8Q9NY65 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBA8Q9NY65 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms