Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGPEP1Q9NXJ5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGPEP1Q9NXJ5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms