Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJC28Q9NX36 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DNAJC28Q9NX36 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms