Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms