Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCF3Q9NUQ8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABCF3Q9NUQ8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms