Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GJB4Q9NTQ9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GJB4Q9NTQ9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms