Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC6A13Q9NSD5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC6A13Q9NSD5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms