Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPRMQ9NS64 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms