Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SH2B1Q9NRF2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH2B1Q9NRF2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH2B1Q9NRF2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms