Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BIN3Q9NQY0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BIN3Q9NQY0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms