Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCUBE2Q9NQ36 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCUBE2Q9NQ36 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms