Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TIMMDC1Q9NPL8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms