Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO1B3Q9NPD5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms