Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB6Q9NP58 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB6Q9NP58 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCB6Q9NP58 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCB6Q9NP58 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCB6Q9NP58 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms