Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBX8Q9HC52 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX8Q9HC52 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX8Q9HC52 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms