Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GGNBP2Q9H3C7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GGNBP2Q9H3C7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms