Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB1BQ9H0U4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB1BQ9H0U4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms