Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIF3L1Q9GZT8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIF3L1Q9GZT8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms