Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR1EQ9GZS1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms