Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRINP2Q9C0B6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRINP2Q9C0B6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRINP2Q9C0B6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRINP2Q9C0B6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRINP2Q9C0B6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRINP2Q9C0B6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRINP2Q9C0B6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRINP2Q9C0B6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BRINP2Q9C0B6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRINP2Q9C0B6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRINP2Q9C0B6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRINP2Q9C0B6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms