Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM5Q9C035 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms