Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SCAPERQ9BY12 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SCAPERQ9BY12 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SCAPERQ9BY12 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms