Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms