Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDUFAF3Q9BU61 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDUFAF3Q9BU61 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms