Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBGCP2Q9BSJ2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBGCP2Q9BSJ2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBGCP2Q9BSJ2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms