Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ0

PYGO2, Pygopus homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO2Q9BRQ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PYGO2Q9BRQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PYGO2Q9BRQ0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms