Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDF4Q9BRK5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SDF4Q9BRK5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDF4Q9BRK5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms