Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOXF2Q9BQY4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms