Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF15Q99988 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF15Q99988 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms