Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MEIS3Q99687 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MEIS3Q99687 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MEIS3Q99687 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms