Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHOX2BQ99453 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHOX2BQ99453 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms