Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNGAP1Q96PV0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNGAP1Q96PV0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNGAP1Q96PV0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms