Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC3BQ96NL0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms