Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CMTM3Q96MX0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CMTM3Q96MX0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms