Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPZA3Q96KX2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPZA3Q96KX2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms