Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABS1Q96KC9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CABS1Q96KC9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms