Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC136Q96JN2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC136Q96JN2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms