Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPIP1Q96JH7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VCPIP1Q96JH7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms